Vejamos então como instalar o Kohana:

• Faça o download do Kohana versão 2.2;
• Descompacte o pacote. Será criado o diretório kohana;
• Envie os arquivos do Kohana para o diretório que o servidor http aponta;
• Edite o arquivo de configuração global application/config/config.php;
• Faça chmod 666 em application/logs;
• Faça chmod 666 em application/cachê;
• Teste a sua instalação: http://localhost.

Caso visualize a página Welcome, a sua instalação está completa!

Removendo o index.php das URLs

# Turn on URL rewriting 
RewriteEngine On 
# Put your installation directory here: 
# If your URL is www.example.com/, use / 
# If your URL is www.example.com/kohana/, use /kohana/ 
RewriteBase / 
# Do not enable rewriting for files or directories that exist 
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f 
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d 
# For requests that are not actual files or directories, 
# Rewrite to index.php/URL 
RewriteRule ^(.*)$ index.php/$1 [PT,L]

Configurações adicionais

Voce pode adicionar outras configurações a partir daquelas que estão localizadas em system/config.

Por exemplo, caso queira configurar o acesso a banco de dados, copie o arquivo system/config/database.php para application/config/database.php e edite os detalhes de conexão.